西元前八千年的北非，夜里有个部族跳舞狂欢，庆祝打猎丰收在他们就寝后，强烈的暴风袭卷这整个村落，村人纷纷走避耀眼的闪电，只有一名年轻的男孩走向它，最后消失在光源里。一九二八年的埃及，数百名阿拉伯人在沙里挖掘，挖出六座写满古埃及象形文字的石碑，没有人知道它们的用途和来源。这时，又有人挖出一个巨大的环状物，称为「星门」。到了现代的洛夏矶，埃及学家丹它尔发现了「星门」的秘密，他与欧尼尔上校的部队，搭乘「星门」前往距地球数百万光年的奇异星球。
年轻女子米歇尔（玛丽·伊丽莎白·温斯特德 Mary Elizabeth Winstead 饰）不久前刚和男友发生争吵，她夜晚驾车奔驰在黑暗的公路上，突然遭遇严重车祸昏迷过去。当她再度醒来时，发现自己被绑住手脚，关在一个密闭的空间里。少顷，一个健硕冷峻的男子霍华德（约翰·古德曼 John Goodman 饰）走了进来。军人出身的霍华德声称地球刚刚遭遇可怕的生化危机，地球人几乎灭亡殆尽。他在数年前未雨绸缪修建了这个设备、资源齐全的避难所，只为生存下去。避难所内，除了霍华德、米歇尔外，还有另外一个年轻男子埃米特。米歇尔对霍华德的说辞半信半疑，她坚信自己遭到了变态狂的拘禁。 真相究竟为何？威胁无处不在……
托马斯（迪伦·奥布莱恩饰）率领的林间斗士在经历了迷宫逃脱和末日丧尸的生死考验后，终于迎来最后的正邪较量。由托马斯、纽特（托马斯·桑斯特饰）等人领军的营救团队，耗时三年筹划营救被抓走的米诺，却意外地发现米诺不在劫获的那截火车上。经调查得知，米诺深陷在WCKD组织的控制之中，托马斯和纽特毅然决定起身前往被称为“最后之都”的人类最后净土，更不惜利用背叛林间斗士投身WCKD的特蕾莎（卡雅·斯考达里奥饰）闯入WCKD，营救米诺和其他人。
