曾经蓝地星最耀眼的第一宗门星辰宗，意外得到了万界至宝“星辰图”，引来了万界之主的窥视，万界之主为了得到星辰图，诱导星辰宗内的高层前往圣星域，并将他们囚禁在“圣星域”当中。星辰宗只剩下了一个护宗长老诸葛浩瀚以及年少宗主楚星河和几个名年少弟子，因实力不足受到了其他宗门压制，被鹰帮的人夺走了宗门之地，少宗主楚星河为了重新夺回曾经的荣耀，寻找被囚禁的父亲和星辰宗的高层，带领门下几位弟子，连闯十二座星界，打败万界之主的手下十二尊星魂强者，最终也从万界之主救回其父亲和星辰宗所有人。
1913年，湖南长沙，毛泽东以第一名的成绩考入了湖南第一师范。五年师范生涯、动荡的时局，尤其在反对袁世凯签订“二十一条”条约复辟称帝的斗争中，一师孔校长被迫逃往日本，面对残酷现实的毛泽东，对教育救国与改良主义信仰产生了动摇！
胡八一等人受陈教授委托，前往南海珊瑚庙岛，雇阮黑师徒乘三叉戟号赴珊瑚螺旋寻秦王照骨镜。历险后坠入归墟，于沉船内得古镜并知阮黑乃多玲仇人。脱险后休整时，突现神秘人持棍逼近守夜的明叔。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
在午夜神秘的钢琴声中凹凸学园的新学期开学了。教师团队对校园中发生的神秘事件含糊其辞，而一个个谜题却总出现在同学们的身边。洒满阳光的美术教室弥漫着浓雾、破旧的老教学楼散发着诱人的香气……幕后主使竟拥有关闭校园的权利！同学们，凹凸学园解谜大事件欢迎加入！
