平凡少年王小修在一次意外中，获得了来自高纬度宇宙文明的空间系统“超能立方”，从而拥有了超凡能力。因被自己恋慕许久的校花沈瑶表白，王小修惹恼了同为沈瑶追求者的不良青年孙俊，王小修靠机智和超凡能力化解了危机，但也引来了更多的祸患。沈瑶被神秘人带去了超凡人的世界，王小修也踏上了救回沈瑶的旅程。和小修一起，在光怪陆离的世界中战斗，在成为绝世强者的路上诠释公平与正义！
超级飞侠乐迪接到一项新任务！一个神秘的包裹，一次跨越大洲的派送，乐迪却因此偶然介入了一场将世界陷于危机的恶作剧中。面对危机，乐迪和其他超级飞侠将发挥各自的救援能力，争分夺秒合力拯救世界！
九州大陆，仙道昌盛，世人皆以拜入仙门为荣。然而界壁裂缝突现，有异界魔族开始偷偷潜入九州仙门。异界魔族潜入各大仙门后，试图逐渐执掌仙门权柄，企图颠覆九州大陆。剑仙牧勋携同道好友阻拦魔族入侵，却不幸中了魔族陷阱，被误以为是仙门叛徒。牧勋为寻找时机，找寻魔族潜伏的线索，决定隐其踪迹不再示人，并将其独子东方灏交由妻子之氏族抚养照顾。身负帝族血脉却灵根不显的东方灏，一直被同族视作庸人，备受欺凌；本是剑仙之后，却因其父被魔族陷害而命途坎坷的他，在危机时刻，毅然凭借不懈努力化险为夷，一步步走向证道成仙之路。太初秘境，昭武王都，东方灏义气挺身，多次救友人于危难之中。同时，东方灏也从未忘记去寻找失踪的父亲。驯蛟龙，争仙魄，修为不断提升的他立志找回父亲，并重新凝聚各大仙门，将魔族赶出九州大陆。
胡八一等人受陈教授委托，前往南海珊瑚庙岛，雇阮黑师徒乘三叉戟号赴珊瑚螺旋寻秦王照骨镜。历险后坠入归墟，于沉船内得古镜并知阮黑乃多玲仇人。脱险后休整时，突现神秘人持棍逼近守夜的明叔。
苟怂女孩苏离离，一朝不幸穿越成为废公主，要替妹妹嫁给世间最可怕的疯皇幽皇伊祁渊！还没上花轿就在策划逃婚的她，终于卷了宫中细软，勾搭小白脸跑路啦！世界这么大，她要去一个神经病幽皇永远都找不到的地方！
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
