一连串人类恶鬼化案件的现场，都拍到了与男主长得一模一样的凶手。女主收到地府方面的通缉令，将男主逮捕归案等待黑白无常审判。为洗脱罪名，男主逼不得已用计胁迫女主一起查明真相。随着案件逐渐清晰，两人揭开了一连串人类恶鬼化案件的阴谋以及凶手和男主的关联，原来一切都在幕后黑手的掌握中。
一把斩神剑，为小镇青年石荒所得，从此担负起救世之则；天北学院入学，莫辱少年志，石荒奋起反抗世家势力；天骄考核，为护帝国安，孤身犯险圣灵潭！
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
