在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
两千年前，阴阳家后人有感于秦始皇焚书坑儒，叹息于阿房宫付之一炬，为“不教天下才情付之东流”，他开始在文人墨客辞世之时，将其元神凝炼成笔，以保其才情流传后世。两千年后，普通大学生罗中夏意外获得李白的青莲遗笔，从此拥有了笔灵带来的超能力。但好景不长，多方势力都对青莲遗笔的强大力量趋之若鹜，也令罗中夏屡涉险境。为躲避纷争，罗中夏一心寻求退笔之法却接连受挫，反倒开始了一段与“管城七侯”的不解之缘．...
汉明帝授史家后裔班超青铜燕符，让他出使西域，寻找长生之法和梦中金佛。班超探寻隐匿于京城的高手，墨家传人、盗门后人，夜郎蛊师等三十六人同行。除却完成皇帝心愿，还为了寻求史家渊源以及陷害自己父亲的凶手。
穿越修仙界十八年，陆安一直是无法修炼的底层杂役。就在他即将被宗门赶走、被系统抹杀时，却因誓死守护乱葬岗，意外激活超级安葬系统。从此，只要站在坟地里，他便天下无敌。欺负他的执事被种进土里，围剿他的宗门强者沦为肥料，就连上界诸神，也逃不过他手中的一把铁锹。
