“在寒冷的冬日，与「黄金庭院」的大家一起做些可爱的事情，尽情留下特别的纪念，迎接属于我们的、独一无二的新年——嘿嘿，是不是很有仪式感呀？我想和大家一起创造更多这样美好的回忆，因为……我最喜欢大家了嘛♪”
凭借魄力和勇气，凡体少年萧云在顿悟系统的帮助下，参加神体大能争夺大帝资格的战斗。可是，百万年前的大帝为何认识他！？未来的他为何留下笔记！？顿悟系统的真正来历又是如何！？所有平行世界将面临巨大危机，唯一拯救者是被众神召唤而来的地球少年！
一心想做个风流潇洒白衣剑客的穿越者孟奇，却在‘轮回空间’的一次次无限流极限任务中画风突变，成了闻名天下的‘雷刀狂僧’，然而这一切原来都在洪荒上古大能的诡谲算计之中。且看无敌逗比小和尚快意江湖，笑傲三界。
在这个世界上有一群人，他们身体上刻有文字“印”，并可以通过念力将“印”转化为超能力施放出来，这种能力被称为言能，而这群人被称为言能师。唯一能够教授这种能力知识的地方，是有着悠久历史，继承了远古文明的万象学城。每一年万象学城都会举办考试，招收有潜力的言能师进入学城学习，并将他们组建成维护世界和平的警卫力量——千从狩。我们的主人公千从虽是个有印无能的哑炮，却也梦想着成为最强的千从狩，并为此进入学城求学，开启了他的不灭人生。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
