《万古神帝》改编自阅文白金作家飞天鱼的同名小说。 八百年前，张若尘身为明帝独子，天资绝世却遭青梅竹马的池瑶公主斩杀；八百年后，他重生在云武郡国的废柴九王子“张若尘”体内，这具身体体弱多病、毫无灵力，与母亲林妃在郡王府备受欺凌。觉醒记忆后，张若尘立誓向已是昆仑界主宰的池瑶女皇复仇，同时守护给予他母爱的林妃。他觉醒时空神武印记，凭前世经验和努力快速成长，岁末考核夺冠后，历经武市斗场厮杀、地府门截杀，进入武市学宫深造。
李无妄某天突然觉醒，发现自己作为反派，正挟持万潮宗圣女晚筝出逃。就在李无妄还没反应过来时，面前出现的“系统”则快速向其发布了任务：剥夺天命之人的天命值。要么完成任务活下来，要么任务失败，成为死于天命主角剑下的蝼蚁。
故事发生在炎帝、黄帝所在的蛮荒时代。正值群雄逐鹿中原之际，天下公认的领袖——神农帝去世，金、木、水、火、土各族群雄皆蠢蠢欲动。波涛暗涌的时代中，少年拓拔野横空出世，在机缘巧合下得到了神农帝临终传承，开始了一段惊心动魄的传奇历程。
万年之前，仙王牧云因持有诛仙图而遭人暗算，残魂沉睡万年之后，在天运大陆南云帝国有名的“废物牧云”身上觉醒。牧云初醒，就受到了学生妙仙语的刻意刁难，牧云轻松的就化解了妙仙语的陷阱，并举一反三的说出了更多的炼丹技巧，让门外的炼丹大师莫问赏识不已。回到家中，牧云得知了要与秦家小姐秦梦瑶结亲的消息。秦梦瑶寒毒在身，活不过二十岁，结亲不过是为了牧家和秦家的利益。但牧林辰的劝说下，牧云以炼丹为条件，答应了这门亲事。炼出了淬骨丹，牧云的修为有了第一次提升。莫问时常来找牧云请教，而秦时雨一直想请莫问来治疗孙女秦梦瑶。莫问暗示让牧云一试，牧云阴差阳错下唤醒了体内的诛仙图，得知秦梦瑶体内的并非寒毒，而是冰凰神魄。牧云治好了秦梦瑶，冰凰神魄的力量使得秦梦瑶修为突飞猛进。在见识到了牧云的能力后，秦梦瑶对牧云充满了好奇和兴趣，于是成为了北云学院的导师，和牧云教导同一个班级。
