在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
动画的故事来源于网络爆红冷笑话“吃饭睡觉打豆豆”的创新延续，述说了呆萌可爱的黄豆，神秘地出现在南极，与一群性格独特的企鹅朋友间的爆笑趣事。呆萌可爱的豆豆拥有极强的好奇心，仿佛有用不完的精力，但由于天生呆萌，经常做出一些让人啼笑皆非的事情。
