宇宙流浪汉李约素无意中发现了多年前失踪的移民飞船“上佳”号，并目睹了令人惊惧的异常现象……人们逐渐发觉了正在逼近人类的巨大危险，几经周折最终科尼尔星域各方势力不得不合力应对强敌。孰料，异族的强大超乎想象，科尼尔星域人类在全军覆没之际，只得派出李约素向银河之心的强大人类文明求救……
《熊出没之探险日记2》则延续了上一季的剧情，除了保留大家最爱的女性角色赵琳外，还加入了人类大反派“天才威”等新角色，使剧集更具矛盾冲突。
胡八一等人受陈教授委托，前往南海珊瑚庙岛，雇阮黑师徒乘三叉戟号赴珊瑚螺旋寻秦王照骨镜。历险后坠入归墟，于沉船内得古镜并知阮黑乃多玲仇人。脱险后休整时，突现神秘人持棍逼近守夜的明叔。
小卒萧陌为爱和军功奋斗三年，却被恋人柳莺儿与将军之子赵昊联手背叛，残忍杀害后抛尸乱葬岗。濒死之际，他唤醒了上古魔刀“幽冥”，获得驱使阴兵之力，化身“活阎罗”归来复仇。他利用附身控魂之能在军营制造恐慌，随后奇袭马匪山寨，建立起自己的第一块根据地——黑石堡，并收服墨家传人墨璇，打造机关。萧陌的势力迅速壮大，引得朝廷大将赵天雄（赵昊之父）率军围剿。萧陌凭借幽冥军与墨璇的机关术大败官军，并在战斗中发现自己竟是前朝大胤皇室遗脉。他以“前朝正统”之名，联合天下义军，与朝廷分庭抗礼。与此同时，他的行为也引起了正道仙门“青云宗”的注意，长老前来讨伐，反被萧陌揭露其门派藏污纳垢，最终败退。然而，这一切都落入了国师的圈套。萧陌击败皇帝，吞噬龙气后，竟无意中撕裂了上古邪神“黑厄”的降临通道。国师亮明真身，欲献祭京城百万百姓迎接邪神。为拯救苍生，萧陌放弃唾手可得的天下，在同伴的协助下，孤身持刀冲入裂隙，与邪神本源展开决战。
异人再度集结，哪都通全新任务开启！甲申之乱到底隐藏怎样的真相？二十四节谷危机重重，一口气半年番，冒险即将展开，敬请期待！
