令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
凹凸世界的创世神是一位很肆意随性的神明。他创造了凹凸世界的无数星球和人民，又随心所欲毫无规律地统治着他们——他让有的星球富饶美丽，让有的星球贫瘠荒凉，让有的子民享受自由幸福，又让有的子民承担重税苦役。创世神设立了七神使，让他们代自己推行神的旨意但是，创世神也不是完全不给他的子民机会——如果有谁想改变自己的命运，实现自己的愿望，那么就去参加“凹凸大赛”吧！参赛者将得到大赛系统赐予的“特殊能力”，并锻炼运用各自的能力不断闯关战斗。只要能在凹凸大赛中获得最终的胜利，那么就能得到一切，并赐予你与“七神使”一样代神统治世界的权力。然而，这些都只是虚伪的表象……
