在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
少女茉莉某天意外穿越到架空的茗族大陆，这里的人种竟然都是兽人。随后遇见了哈士奇血统兽人少年龙井,傲娇赤狐少女祁红等同伴。意料之内的成为了传说中唯一的魔法师，展开了一段猫飞狗跳的冒险故事。
董卓火烧洛阳后，关东联军与西凉军于虎牢关狭路相逢。关羽、张飞协助大哥三英战吕布，刘备终于一战成名。吕布暗中、要挟残兵协助自己暗杀董卓。残兵前往长安途中遭遇袁绍军，幸得刘关张相助，刘备误认撩原火为子龙。长安城内，残兵和吕布联手，对抗以李儒为首的西凉众将。双方斗智斗勇，李儒最终和董卓一同殒命。
故事以猫咪的视角瞥见激烈的战场、历史的一瞬、动人的亲情、未来的幻想；通过水墨、二维、三维、定格等多样化形式呈现极具东方韵味的中式美学；十个光怪陆离的有关于猫咪的神秘画卷徐徐展开。
