《赛尔号之圣者逆袭》是《赛尔号》动画片的续集。讲述的是2110年，地球能源已接近枯竭，环境污染日趋严重。 为了实现地外星系探索计划，人类制造了名为赛尔的机器人，并建造能源探索飞船赛尔号，寻找传说中的无尽能源。可就在找到无尽能源的时候，无尽能源被宇宙海盗欧比组织摧毁，赛尔们不得不去寻找藏在宇宙深处，由谱尼看守的第二个无尽能源……
水门都市普利斯特拉一战中，昴一行艰难取得了胜利，但代价却过于沉重。由于"暴食"的权能，蕾姆陷入沉睡，库珥修失去了记忆，而尤里乌斯则被夺走了名字。 在寻找拯救他们的线索的过程中，昴得知了那位据说能看透一切、拥有所有知识的"贤者"夏乌拉的存在。 下一个目的地便是贤者居住的"昴宿星团观测塔"——那是矗立在就连最强的"剑圣"莱因哈特都未能征服的大沙漠"奥古利亚沙丘"深处的、位于世界尽头的巨塔。 肆虐的自然灾害、未知的魔兽，以及超乎想象的威胁，重重险阻横亘在前。为了与同伴一起，夺回失去的一切，少年赌上性命的旅程就此拉开序幕——
在游戏中心打工的青年草壁莲司，偶然目睹了一幕：情人节当天，一位英国少女莉莉独自一人沉迷于抓娃娃机。无论尝试多少次，她始终无法抓到奖品，眼看着要落泪的她，让莲司忍不住伸出援手。在成功抓到娃娃后，莉莉几天后送给莲司一张意想不到的信息卡——“Be My Valentine!”（请做我的恋人！）这是与一位可爱而天真烂漫的英国少女的邂逅，一个因误会而起的异文化交流故事，就此在游戏中心展开！
