《女生宿舍日常第二季》主要讲了四个不同背景的女大学生，同住一个宿舍发生的奇妙故事！二哈小斌斌、猥琐的韦彤、拖延症患者大圆以及高冷腹黑的狮兄，各自生活习惯相互交织碰撞，开启了奇葩的大学生活！原本以为这就是全部了！没想到某天又有一只猫从天而降，兜兜转转竟被小斌斌撸走，抱回宿舍养着，至此，709A全员到齐！
像少女漫画里那种酸甜的恋爱，肯定不会降临到我身上……因为我是对自己的外貌没有自信、不受欢迎的女高中生田端花。 花虽然憧憬着像少女漫画般的恋爱，但由于她总是消极思考，常常在教室的角落里默默度过时光。她的高中生活因清晨在教室被校园等级顶层的帅哥上野阳介目睹了“尴尬的一幕”而发生了改变！以教室里的那件事为契机，阳介和同学们开始有了更多交流，花周围渐渐热闹起来！孤独的丧女高中生迎来了春天的预感！？搞笑之中再搞笑，偶尔心跳加速的新型校园恋爱喜剧，正式开课！！
黑教廷欲计划利用明珠主校区考核夺取莫凡身上的地圣泉。宇昂放出暗影妖兽的假消息设计莫凡，不料许昭霆却先落入埋伏。莫凡救下张璐璐，许昭霆却被与宇昂变成了黑畜妖，被迫向张璐璐动手。人性未泯的许昭霆提供了黑教廷蓝衣执事的线索。莫凡悲痛不已，决定先发制人。 莫凡将一滴地圣泉放在暗影妖兽体内，借此引蛇出洞，果不其然发现内鬼傅天明。众人不明真相，反而围攻莫凡。莫凡不慎掉入宇昂的陷阱，面对诅咒畜妖的攻击，却接到唐月命令要拖住宇昂的行动。原来蓝衣执事正在冒险逗留等待宇昂。再争取一些时间，审判员夜鹰就可实施抓捕。 拉锯战后，魔法阵消失，宇昂下令围绞莫凡。莫凡忍无可忍，释放玫炎气焰取得了胜利。宇昂见势逃离现场，身受重伤的莫凡却遭到了众人的污蔑。好在夜鹰及时出现真相大白。考核风波结束后，莫凡、赵满延等人被定为交换生，将去往帝都学府。两校展开切磋，莫凡展示出超强实力战胜穆宁雪...
以沉默的出租车司机「小户川」为主角，故事围绕在他与各种性格古怪的乘客之间，最终将联系到一名高中少女失踪的真相。
