主角秦尘本是武域中最顶尖的天才强者，却遭歹人暗算，陨落大陆禁地死亡峡谷。必死无疑的秦尘，却意外触发神秘古剑的力量…… 三百年后，天武大陆偏僻之地，一位同名少年意外继承了秦尘的意志。作为大齐国军神定武王的爱孙，却因生父来历成迷，母子二人在定武王府中受尽冷遇，相依为命。 为了重写望日的强者神话，也为了守护自己所爱的一切，秦尘毅然决然扛起维护天下五国的大任，再度踏上武道之路。
立下赫赫战功的北境大将军裴旻，因莫须有之罪名，被满门抄斩。在西岭籍籍无名的草根少年宁奕，机缘巧合，救下了将军府唯一的幸存者，裴旻的女儿，自此一大一小，兄妹二人，艰难求生。 三位皇子争夺皇位，以天下为棋局，众生为棋子。宁奕带着“妹妹”走入天都皇城。在这场乱局之中，他要求生， 便必须从“棋子”的身份，跳脱出来，成为“棋手”。宁奕别无依靠，唯有一把剑。
相传黑暗之门内，蕴涵着无穷的邪恶能量。只要有人铸造出黑龙剑，就可以打开黑暗之门，吸取黑暗之门内的邪恶能量。灵山门门主知道这一消息后，阴谋夺得黑龙剑的铸造秘籍，秘密铸造黑龙剑。 黑龙剑即将出世！ 一个阴谋已经笼罩森林大地。要想阻止灵山门门主的阴谋、阻止黑暗门打开，依照祖训：在七七四十九天之内，到小和山与光明剑的传人会合，由铸剑人与虹猫一起破解长虹剑上隐藏的密码，找到铸造光明剑的七样必不可少的宝物，最后铸造出光明剑。 经过一番周折，七侠找到了光明剑的铸造人，并开始准备铸造光明剑。众人齐心协力，一次又一次挫败了灵山门门主的阴谋阻止。就在灵山门门主借助星光，完成对黑龙剑第七次淬火、欲打开黑暗门之时，虹猫等七侠将七柄宝剑投入火炉，光明剑出世了！虹猫手执光明剑，粉碎了黑龙剑，阻止了黑暗门的打开……
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
