在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
从小被父母灌输宅文化，却竭力不想跟“宅”扯上关系的女生佟琪，一直视自己的同桌——纯洁的三次元阳光男生杨唯为偶像。没想到有一天，竟从这位“偶像”口中听到了“腐圈”的词……腐女妈妈与天然少年，宅系父母与吐槽疫女儿，二次元一代与三次元二代的爆笑生活即将展开！
伍六七接到神秘任务过程中却意外丧失记忆，为了唤醒记忆，伍六七去到过往记忆发生的地方见到记忆相关的人，其身世之谜也随之逐渐浮出水面。
天赋超群的习武者李阎由于身患绝症，只剩下几个月的生命。他在身陷绝境时意外遇到了一个自称“貘”的男人，被送入“阎浮果树”的一颗果实中。李阎必须在时限内完成系统发布的三个任务，并通过拳赛赚钱换取阎浮点数以购买能够治愈绝症的药剂。随着深入了解自己所在的龙渊城寨，李阎被逐渐卷入城寨内的争端，还察觉到有其他阎浮行走在暗中与自己竞争。突破重重困难后，李阎终于成功完成任务，也获得了新生。
