神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
伯伦希尔魔法学院的教授永乐在图书馆偶遇了一只叫灰羽的精灵，得知精灵都是有愿望未完成才会留在世间，永乐决定帮灰羽完达成愿望。因为灰羽喜欢听永乐读书，永乐便经常与灰羽挑灯夜读，灰羽也一直听得兴致盎然，一人一精灵相处好不融洽。可没想到当永乐帮助灰羽实体化之后，灰羽竟然性情大变，为了让灰羽不再继续黑化，永乐不得不让灰羽消失在世间……
载初元年，神都洛阳。武后大权独揽，称帝在即，她向全天下发布“求才诏”，宣布重开殿试。消息一出，全国能人贤士蜂拥而至，此时洛阳城却冒出来一只肆无忌惮的狐妖，她神出鬼没，专爱偷袭年轻举子。举子接连失踪，坊间谣言漫天，百姓惶惶不安。 精通“圜诡之术”的连山堂后人裴坤也在此时来到洛阳，阴差阳错卷入了一场声势浩大的“捉妖”行动，裴坤凭一己之力击退狐妖，并揪出了潜伏在太平公主身边的春秋道杀手白鹤，高调亮相的裴坤引起洛阳城内多方势力注意。 裴坤一心想要完成师父遗愿查清当年真相，他联手羽林卫和司刑寺，并且武后的情报总管公子楚也向他抛出橄榄枝。原来公子楚早已监测到蛰伏已久的古老组织春秋道即将重现江湖，狐妖只是障眼法……
讲述了小绿和小蓝分别化身成为了魔王小绿和骑士团团长小蓝，在一次次的对战日常中两人逐渐解除对立的人类世界与魔王世界之间的隔阂，敞开心扉了解彼此，走上冒险之旅的暖心故事。
千百年前，神州大地遍布着天地灵气，而能够驱使灵气为己所用的便是驱魔师，他们的使命便是制止千年一现世的天魔为祸人间。然而汉代却发生了天地灵气一夜之间消失殆尽的惨剧，史称“万法归寂”，失去了力量的驱魔师们也逐渐退出了人们的视野。秦晋割据时期战火不断，枉死者的怨气成为了天魔复生的原料；为阻止它的阴谋，世间最后一位大驱魔师陈星带着寄宿在他三魂七魄中的宝物“心灯”踏上旅程，前往襄阳城寻找命中注定将与他共同携手驱魔的护法武神——项述。
遥远的上古时代，人类文明之外有四块神秘的大陆。在这里，人和爆兽龙蛋和平相处，直到有一天，冰雪部落企图利用龙蛋的力量支配世界，引来另外三个部落齐心对抗，结局四块大陆受到重创，陷入了沉睡当中。转瞬千年已逝。张天昊是龙卷部落的后人，机缘巧合之下，他邂逅了上古时期遗留下的爆兽龙蛋，并结识了其它部落的后裔。他们志同道合，结伴阻止冰雪部落的传承者——穆非的阴谋 。华丽又刺激的冒险之旅，就此展开。
人妖共存又相争的世界，修炼术法、以斩妖除魔为己任的人们被称为妖师。国御妖师队长祁晓轩因一次意外结识了浪子虎子，二人共同踏上除魔卫道的旅途。现如今，世间已历经五百年的平静，妖魔们早已蠢蠢欲动，为他们的前路蒙上阴霾……
天启元年，机关盛行，新旧党派，争权谋乱。齐南府秀才沈问，擅木工机巧之术，某日在路上无意间卷入一起皇宫秘宝失窃案，由此结识了锦衣卫总旗沐思卿。沈问发现锦衣卫寻找的秘宝竟然是当年导致他满门被灭的六合兽图，六合兽图内有皇朝隐秘，为了寻找灭门仇人以及解开六合兽图的秘密，沈问决定暗中布局混入北镇抚司寻找当年真相。
