在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
宅男林北辰在机缘巧合下得到一部手机，手机带他进入到了一个叫做东道真洲的世界，在这里，他成为了北海帝国十大名将之一【战天侯】林近南的嫡子，同时也是个臭名昭彰的败家子，且天生带有脑疾。适逢战天侯林近南战败，家道中落，失去了靠山的林北辰，被各路‘仇人’堵在学校里无法出门，危急时刻，他惊讶地发现，自己随身带来的手机，竟是一个可以辅助练功的外挂神器。依靠这个神器，林北辰开启了自己的爆笑逆袭之路。
神遗大陆，百族争锋，武者为王。姜云曾是皇城天一武府武首，不想被夜天邪废掉武脉，天才变废人，不屈命运时，意外觉醒剑魂骨，在剑道之主剑妙禅的帮助下觉醒万古剑脉，成为凡尘域唯一的超凡剑修。原本打算潜心修行以便早日手刃仇人的姜云，被妻子的青梅竹马凌少风盯上，凌少风联合多个势力对付姜云，姜云为护妻子及唐家周全，奋力抵抗，最后不仅全面瓦解凌少风等恶势力，更揭开灵域企图侵占神遗大陆、灭掉人族的阴谋。为了人族的命运，姜云不得不暂时放下仇恨，与伙伴们携手抵抗灵域的攻击，共同拯救神遗大陆与保护人族。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
这是一个由人们的信赖造就英雄的世界，而获得最多信赖的英雄被誉为一一 X 。在这个世界里，人们的信赖是可以被数据统计出来的，并且这些数值会反映在每个人的手腕上。只要获得足够多的信赖值，普通人也能拥有超能力，成为拯救世界的超级英雄。然而，持续变化的信赖值让英雄之路充满未知．...
