在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
一场全球性地质灾难使得大陆处于割据状态，由不同的武装集团占领。大陆相对繁荣的萨科城被优人军阀攻占，萨科城北部为北域，西部为西庭，还有其周边五大城市原住民联合组织的五城联军，多方各自为政。由贺将带领的东邦小队与优人正面对抗，引起了多地势力的注意。与此同时，各地冲突不断升级，贺将被迫卷入激烈的斗争中。
古药大陆，万族林立，丹师为尊；双生武脉，再现世间！醉卧美人膝，成就丹道至尊！
林月桐婚后八年发现丈夫顾明轩联合情人苏婉、婆家图谋自家百亿林氏集团，甚至下药谋害她与外公。她结识受尽原生家庭拖累的苏洛，二人结成同盟步步反击，粉碎顾明轩夺权阴谋。案件牵扯京圈阎氏跨国洗钱黑幕，苏洛隐藏的叶家嫡长孙身世浮出，假少爷叶辰接连布局加害。林月桐与苏洛联手周旋资本博弈、连环暗算，收集完整罪证，最终扳倒阎景渊、叶辰一众反派，稳固林氏与叶氏产业，完成双向救赎。
浮云司“影子”卧底陆尘因破坏魔教降神咒受到黑火诅咒，修为尽毁。度过长达十年的流亡隐居生活后，师父天澜再度现身，交给陆尘前往昆仑派寻找魔教卧底的任务，并且为修复受损的五行神盘，陆尘奉命成为昆仑派百草堂的杂役弟子。在执行任务的过程中，他结识了诸多好友与一生挚爱易昕，逐渐感受到人间温暖，同时从种种蛛丝马迹中触及到了昆仑背后的秘密，发现昆仑禁地封印的黑龙并非邪恶魔物，而一直声称为了大义的天澜竟也另有所图。认清事实的陆尘一时迷茫，在易昕的鼓励下决定正视过去，不再拘泥于所谓正邪之分，而要遵从本心行正确之事。
万族咆哮，撕裂苍穹！全面转职时代彻底降临！觉醒日，李一觉醒至高阴神职业——阴司至尊！生死簿翻页，万灵寿数由吾定；轮回盘转动，诸界亡魂归吾掌！十万鬼将，百万阴兵，一念断生，一念断死，诸天万界我为尊，吾意即天意！面对异族屠戮，人族悲歌响彻寰宇之际。李一突破职业桎梏，成就酆都大帝，硬撼异族三大邪神！阴司之主，既掌生死，亦镇苍生！那一战，天地震动！最终李一成功消灭邪神异族，将和平与安宁再次带给了这颗饱经风霜的星球！
