飞贼风铃儿与商贾之女白钰袖一同结伴闯荡江湖，殊不知在她们的背后正孕育着一场巨大的阴谋。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
日本国中女生铃木夕梨被咒术牵引至纪元前的赫梯帝国，并长期遭受娜姬雅王后的追杀，目的在于以她为祭品咒杀凯鲁王子。在凯鲁的庇护与指导下，夕梨从误打误撞开始学习成长，到最后能够与王太后在政治舞台上一较高下，其强大的行动力以及敏锐卓越的决策能力，被凯鲁和部下认定为唯一的王后人选。历经凯鲁登基为王、放弃回日本、多次被掳、流产以及政治斗争之后，娜姬雅终于自王宫中被排除，由夕梨登上后位继承达瓦安娜的名号，与凯鲁两人共同创造盛世。
青年·下吕担任家业延续数百年的杀手『用毒人』。 从事见不得光的工作，又不擅长跟女性交流，他认为自己不该结婚。 然而，为了延续『用毒人』的血统，老家宣布将强制要求他的妹妹生下接班人。 此时，下吕遇见了原本是工作目标的婚姻骗子‧城崎…？ 「那样的提案〈求婚〉，还是头一遭。」 把婚姻骗子当成提供建议的人，展开了杀手的婚姻活动！
突然出现的“鬼兽”以压倒性的力量开始攻击人类，城市被摧毁，绝望笼罩着人们，在所有人都快要放弃的时候，有一个影子迎战鬼兽！“你们这些家伙，惹到我了！！”人类面前出现了一丝希望，那竟然是一只鸡！
绝大部分的故事都发生在美国一个名为小镇村（The City of Townsville）的都市，飞天小女警则是这座城市的保护者，举凡阻止银行抢案、火场救援、防止怪兽破坏城市等，都是她们的工作。 飞天小女警对付犯案者及怪兽毫不留情，几乎总是会狠狠的揍他们一顿，再把他们丢进监牢或交给警方。 飞天小女警有专属的热线电话，市政厅、小橡树幼稚园和基妮老师家里都设有分机。发生犯罪事件时通常是由市长打电话通知飞天小女警。飞天小女警的主旨是“英雄不是绝对的善，坏蛋也不是绝对的恶…因为每个人都有好的本性和坏的本性，只看你怎么选择。 结尾画面和结尾语亦为本作之特色，各故事皆有结尾画面和结尾语。大部分的结尾画面为飞天小女警三人，结尾语通常则是“一天又平安的过去了，感谢飞天小女警的努力！”但前两者并非每集皆一成不变；较可能出现的会是解决该集纷争最有助力的人、事、物，而也并非绝对单一个体（也可能复数）。
