在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
随着武魂融合技的锋芒消散，切磋赛最终以唐舞麟所带领的一年级组获胜而告一段落。片刻宁静后，一年级生们的期末考试也如期而至。学院提出的种种难题令众人捉襟见肘，唐舞麟等人也不例外。他们使出了各自的看家本领，为通过考试，跌跌撞撞的踏上了明都之行……
蓝星人周雨肥在一场粒子对撞实验中意外跃迁到一个全民修仙的异世界大陆，为了找到这个世界的粒子加速器重返蓝星，道术小白周雨肥在猫妖黑福和龙女林白的帮助下，结合现代思维知识逻辑，在茅山学宫开始学习茅山道术。
衰仔高三生路明非，突然收到了一封来自卡塞尔学院的邀请信，这一件天上掉馅饼的大好事砸得他有一些不知所措，经历了一系列事件后，路明非决定面对未知，加入卡塞尔，谁知竟被告知，卡塞尔的学习之旅是为了——屠龙。学院“自由一日”和“3E”考试等等不同寻常的事件让他不得不相信自己真的加入了一个目标是屠龙的神秘组织，随后去往青铜城的行动也让他直面了自己已然到来的、不平凡且残酷的人生……
吊儿郎当的咸鱼哥，依旧在鱼神岛上享受着平凡且快乐的日常生活。而来自南天门集团的神仙们，为了调查失窃的神牌位，打破了小岛原本的平静。 随着接二连三的意外事件发生，一个个围绕着“鱼神”与“海妖”的谜团，也因为咸鱼哥的意外卷入而慢慢展开。 面对种族的差异和世间的偏见，咸鱼哥将如何用他独特的处事之道，通过这次的考验呢．.
随着小众的怪兽电影日趋没落，痴迷于怪兽片类型的导演——蒙奇，也对一直以来的坚持产生了迷惘……却没想到，有朝一日虚构的怪物竟然真实出现在他面前。为了能实现愿望，蒙奇决定与魔族少女莉雅合作，帮助她拍摄以魔族为主题的电影。然而跟随着拍摄进程，蒙奇却发现，异界的一切竟都与自己息息相关……
五十年前，江湖突然被 “混沌”入侵，慕容穹组建魔教对抗，艰难苦战不得胜利。神使易枝花降临，教会众人妖化功法成功战胜混沌。可神使离开，妖化功法传入江湖后失控，慕容穹失望退隐。他的手下余化冰趁机上位，改良妖化功法，竟创造出朋克真气时代，让江湖欣欣向荣，但代价就是江湖客们都变成了“上功怪“”。有着赤子心的少年东方胜，找到了归隐在向西饭店的慕容穹，想靠他恢复昔日江湖荣光，啼笑皆非的故事自此拉开帷幕……
